Да, страховые не хотят раставаться с деньгами..
Мне со страховой повезло, возмещали 2 раза (не по моей вине, первый раз - кто-то дверь поцарапал из "пешеходов", второй ДТП виновник скрылся) в полной мере и все быстро. Никаких независимых экспертиз не было, только счет-фактура с офиц станции.
Я думаю Вам стоит дергать их и не идти на поводу. Ремонт исключительно на официальном СТО. И написать заявление на имя директора о не выплате компенсации по стеклу (и указать обязательно сумму, приложить копии платежек).